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户口不在一起，想证明是亲生父子关系，方法有：最有效、最直接的办法是：子女和父、母一起做亲子鉴定，合法鉴定机构的鉴定结论是最权威的证明。还可以子女的出生证明来证明：出生证明上一般都填写有父母、子女的姓名、年龄、性别等，而且是医院在子女出生的当时发给，证明力也较强。如果当事人有法律依据：《出生医学证明》的，可以以此来证明当事人和父亲之间，存在父子关系；如果当事人出生年代较早，不能提供《出生医学证明》的，当事人可以去户口原籍地的村委、居委等部门，让对方出具证明。也可以当事人写一份亲子关系证明后，再让户口原籍地的邻居出面佐证；当事人具体可咨询要求提供亲子关系证明的派出所工作人员，依对方的提示办理。

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如果证明父母与子女的关系，可以根据自身情况从以下两种证明材料中任选其一代替证明信：如果您以前办理过出生公证或亲属关系公证，可以提供原出生公证书或亲属关系公证书;《出生医学证明》或《独生子女证》(如果《出生医学证明》或《独生子女证》内容缺项、涂改、填写字迹不一致，《出生医学证明》或《独生子女证》不能作为唯一证据使用，还需提供其他证明材料)。如您提供《出生医学证明》或《独生子女证》作为证明材料还需提供父母结婚证。法律依据：《中华人民共和国民法典》第二十六条父母对未成年子女负有抚养、教育和保护的义务。成年子女对父母负有赡养、扶助和保护的义务。

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父女关系的证明可以提供身份证、出生证明等相关文件进行证明。一般情况下，父子或父女关系的证明，可以到当地派出所开具证明。如果派出所没有相关记录，可以通过以下方式证明：1、有出生证明的，可以用出生证证明关系；2、由村委会或居委会开具相关证明；3、亲子鉴定。另外，如果父子或父女在同一户口本上的，可以拿着你的户口本原件及户主以及母亲和你的相关内容页复印件，就能证明你们之间的血亲关系。而有些地方会要求写一个纸质的亲属关系证明，你按照证明的一般格式来写就可以了。法律依据：《中华人民共和国户口登记条例》第七条婴儿出生后一个月以内，由户主、亲属、抚养人或者邻居向婴儿常住地户口登记机关申报出生登记。弃婴，由收养人或者育婴机关向户口登记机关申报出生登记。第八条公民死亡，城市在葬前，农村在一个月以内，由户主、亲属、抚养人或者邻居向户口登记机关申报死亡登记，注销户口。公民如果在暂住地死亡，由暂住地户口登记机关通知常住地户口登记机关注销户口。公民因意外事故致死或者死因不明，户主、发现人应当立即报告当地公安派出所或者乡、镇人民委员会。第十九条公民因结婚、离婚、收养、认领、分户、并户、失踪、寻回或者其他事由引起户口变动的时候，由户主或者本人向户口登记机关申报变更登记。第二十条有下列情形之一的，根据情节轻重，依法给予治安管理处罚或者追究刑事责任：（一）不按照本条例的规定申报户口的；（二）假报户口的；（三）伪造、涂改、转让、出借、出卖户口证件的；（四）冒名顶替他人户口的；（五）旅店管理人不按照规定办理旅客登记的。

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